물리치료과는 세계적 흐름에 맞추어 정형물리치료, 신경계물리치료, 통증물리치료로 전공을 세분화하여 교과과정을 운영하고 있으며 국가면허시험에 대비한 교육을 통해 졸업생들의 국가면허 취득을 능동적으로 지원한다.
또한 졸업 후 4년제 대학에 편입하지 않아도 직장생활과 병행하여 본교 평생교육원 학점은행제에서 소정의 과정을 이수 후 교육인적자원부에서 수여하는 보건학사를 취득할 수 있다.

물리치료는 요통, 오십견, 관절염과 같은 근골격계 질환과 뇌성마비 및 뇌졸중과 같은 신경계 질환및 각종 근골격계 통증 질환을 치료하는데 산업재해와 교통사고, 그리고 고령화 사회 등으로 인해 환자가 날로 증가하는 추세이다.
본 학과에서는 전기치료실습실, 기능훈련실습실, 측정 및 평가 실습실, 기초의학실습실에서 실습 및 전공 관련 지식습득을 지원하고 있다.

또한 정기적인 사회봉사활동을 통하여 지역주민과의 연계를 유지하고 지식나눔을 실천하고 있으며, 사회봉사를 통하여 자연스럽게 참된 인간성 배양, 다양한 실무 능력 향상 및 배움의 실천을 경험할 수 있다.
실제로 군장대학교 물리치료과 봉사동아리 GPS는 2016년 전라북도청으로부터 표창장을 받는 등 다양한 창의적인 활동을 통하여 우수한 성적을 인정받고 있다.